kappa | index /home/orient/pydpi/drug/kappa.py

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The calculation of Kier and Hall's kappa indices based on its topological
structure. You can get 7 molecular kappa descriptors. You can
freely use and distribute it. If you hava any problem, you could contact
with us timely!
Authors: Dongsheng Cao and Yizeng Liang.
Date: 2012.09.18
Email: oriental-cds@163.com
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Modules
`` |  |
rdkit.Chem | rdkit.Chem.PeriodicTable | rdkit.Chem.rdchem |

Functions
`` |  | CalculateFlexibility(mol) `################################################################# Calculation of Kier molecular flexibility index ---->phi Usage: result=CalculateFlexibility(mol) Input: mol is a molecule object. Output: result is a numeric value. #################################################################` CalculateKappa1(mol) `################################################################# Calculation of molecular shape index for one bonded fragment ---->kappa1 Usage: result=CalculateKappa1(mol) Input: mol is a molecule object. Output: result is a numeric value. #################################################################` CalculateKappa2(mol) `################################################################# Calculation of molecular shape index for two bonded fragment ---->kappa2 Usage: result=CalculateKappa2(mol) Input: mol is a molecule object. Output: result is a numeric value. #################################################################` CalculateKappa3(mol) `################################################################# Calculation of molecular shape index for three bonded fragment ---->kappa3 Usage: result=CalculateKappa3(mol) Input: mol is a molecule object. Output: result is a numeric value. #################################################################` CalculateKappaAlapha1(mol) `################################################################# Calculation of molecular shape index for one bonded fragment with Alapha ---->kappam1 Usage: result=CalculateKappaAlapha1(mol) Input: mol is a molecule object. Output: result is a numeric value. #################################################################` CalculateKappaAlapha2(mol) `################################################################# Calculation of molecular shape index for two bonded fragment with Alapha ---->kappam2 Usage: result=CalculateKappaAlapha2(mol) Input: mol is a molecule object. Output: result is a numeric value. #################################################################` CalculateKappaAlapha3(mol) `################################################################# Calculation of molecular shape index for three bonded fragment with Alapha ---->kappam3 Usage: result=CalculateKappaAlapha3(mol) Input: mol is a molecule object. Output: result is a numeric value. #################################################################` GetKappa(mol) `################################################################# Calculation of all kappa values. Usage: result=GetKappa(mol) Input: mol is a molecule object. Output: result is a dcit form containing 6 kappa values. #################################################################`

Data
`` |  | Version = 1.0 periodicTable = <rdkit.Chem.rdchem.PeriodicTable object>