README.md
autopvs1-batch.py
setup.py
autopvs1/__init__.py
autopvs1/autoPVS1.py
autopvs1/cnv.py
autopvs1/config.ini
autopvs1/pvs1.py
autopvs1/read_data.py
autopvs1/splicing.py
autopvs1/strength.py
autopvs1/utils.py
autopvs1/data/AutoPVS1.png
autopvs1/data/AutoPVS1App.png
autopvs1/data/PVS1.level
autopvs1/data/clinvar_pathogenic_GRCh37.vcf
autopvs1/data/clinvar_pathogenic_GRCh38.vcf
autopvs1/data/clinvar_trans_stats.tsv
autopvs1/data/exon_lof_popmax_hg19.bed
autopvs1/data/exon_lof_popmax_hg38.bed
autopvs1/data/expert_curated_domains_hg19.bed
autopvs1/data/expert_curated_domains_hg38.bed
autopvs1/data/functional_domains_hg19.bed
autopvs1/data/functional_domains_hg38.bed
autopvs1/data/hgnc.symbol.previous.tsv
autopvs1/data/mutational_hotspots_hg19.bed
autopvs1/data/mutational_hotspots_hg38.bed
autopvs1/data/ncbiRefSeq_hg19.gpe
autopvs1/data/ncbiRefSeq_hg38.gpe
autopvs1/maxentpy/__init__.py
autopvs1/maxentpy/maxent.py
autopvs1/maxentpy/maxent_fast.py
autopvs1/maxentpy/data/matrix3.msg
autopvs1/maxentpy/data/matrix5.msg
autopvs1/maxentpy/data/score3_matrix.txt
autopvs1/maxentpy/data/score5_matrix.txt
autopvs1/pyhgvs/__init__.py
autopvs1/pyhgvs/models.py
autopvs1/pyhgvs/utils.py
autopvs1/pyhgvs/variants.py
autopvs1_batch/__init__.py
autopvs1_batch/bed.py
autopvs1_batch/pvs1.py
autopvs1_batch/utils.py
autopvs1_batch/vcf.py
autopvs1_batch/vep.py
autopvs1_batch.egg-info/PKG-INFO
autopvs1_batch.egg-info/SOURCES.txt
autopvs1_batch.egg-info/dependency_links.txt
autopvs1_batch.egg-info/top_level.txt